In geval van disfunctioneren is de overheidswerkgever soms gehouden om een onderzoek in te stellen naar eventuele medische oorzaken van de ongeschiktheid. De ambtenarenrechter kan een besluit waarmee een ongeschiktheidsontslag werd verleend vernietigen wanneer een dergelijk onderzoek ten onrechte niet heeft plaatsgevonden. Het is vaste jurisprudentie van de Centrale Raad van Beroep dat een dergelijk onderzoek moet plaatsvinden indien er aanwijzingen zijn dat het disfunctioneren wordt veroorzaakt door of samenhangt met een ziekte of gebrek van de ambtenaar.
Indien de werkgever bij voorbereiding van een ongeschiktheidsontslag geen onderzoek heeft laten uitvoeren door de bedrijfsarts naar de vraag of de ongeschiktheid wordt veroorzaakt door een medische aandoening, kan dit verzuim nog in de bezwarenfase hersteld worden. Een dergelijk gebrek vormt geen reden om het ontslagbesluit in te trekken.
De Centrale Raad van Beroep oordeelde op 22 december 2008 bij wijze van voorlopige voorziening over een schorsingsverzoek van een ambtenaar die was ontslagen vanwege ongeschiktheid. De ambtenaar had bezwaar gemaakt tegen het ontslagbesluit waarna de bezwarencommissie had geoordeeld dat er alsnog een medisch onderzoek moest worden ingesteld naar de oorzaken van de ongeschiktheid. De ambtenaar weigerde vervolgens medewerking te verlenen aan een onderzoek omdat hij al was ontslagen. Het ontslagbesluit was volgens hem gebrekkig tot stand gekomen omdat er geen medisch onderzoek had plaatsgevonden. Volgens hem kon dit gebrek niet worden hersteld in de bezwarenfase. De ambtenaar meende dat het ontslagbesluit eerst ingetrokken of opgeschort moest worden alvorens het onderzoek kon worden verricht.
De Raad was het hiermee niet eens. Volgens de Raad kunnen gebreken in de besluitvorming in de bezwarenfase worden hersteld en kan de motivering van een besluit worden aangevuld met bijvoorbeeld de uitslag van een medisch onderzoek. In dat kader kan een bestuursorgaan volgens de Raad in de bezwarenprocedure een gewezen ambtenaar verzoeken om mee te werken aan een medisch onderzoek zonder dat het ontslagbesluit is ingetrokken of opgeschort.